Отдел молекулярных исследований

Отдел молекулярных исследований является структурным подразделением Северо-Западной испытательной лаборатории ФГБУ «ВНИИЗЖ» и осуществляет свою деятельность на двух площадках в г. Санкт-Петербург, Московское ш. 15, лит. А и в г.Псков, ул. Николая Васильева, 77 в соответствии с Законом РФ «О ветеринарии», ветеринарно-санитарными требованиями, Уставом учреждения, ГОСТами, нормативно-правовыми актами РФ, ГОСТ ISO/IEC 17025-2019, критериями аккредитации и документами в области стандартизации; правилами, методами исследований (испытаний), касающихся материалов, поступающих на лабораторные испытания; требованиями системы аккредитации испытательных лабораторий; национальными и международными стандартами, методическими указаниями, наставлениями, и др. руководящими документами по вопросам ветеринарии и карантина растений и методов проведения лабораторных исследований.

В штат отдела входит 10 опытных высококвалифицированных специалистов, имеющих соответствующее образование (агрономия и ветеринария). Сотрудники отдела периодически принимают участие в организации и проведении семинаров, стажировок, курсов повышения квалификации по направлению деятельности для специалистов лабораторий. Компетенция специалистов отдела ежегодно подтверждается при проведении межлабораторных сличительных испытаний, провайдерами которых являются ФГБУ ВГНКИ, ФГБУ ВНИИЗЖ, ФГБУ ВНИИКР, используя метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени». Высокая квалификация и профессиональная подготовка специалистов позволяют ежегодно осваивать и внедрять в лабораторную практику новейшие методики, позволяющие расширить спектр исследований по данному направлению.

Отдел оснащен необходимым современным высокотехнологичным оборудованием ведущих российских и зарубежных производителей, позволяющим в короткие сроки проводить лабораторные исследования, а также  реактивами, тест-системами, расходными материалами.

Для проведения исследований отдел укомплектован: 

- 5 модулей измерительных в составе термоциклера для амплификации нуклеиновых кислот CFX96 C1000 Touch, (Bio-Rad Laboratories Inc. США) обеспечивает проведение ПЦР с возможностью регистрации продуктов реакции в режиме реального времени.;

- 6 приборов для проведения полимеразной цепной реакции в режиме реального времени Rotor-Gene Q 5plex;

- Устройство секвенирования ДНК (генетический анализатор) 3500, Hitachi High-Tehnologies Corporation и два устройства «Нанофор-05»

Методами исследований являются:

- ПЦР – полимеразная цепная реакция, как наиболее современный метод молекулярной биологии, имитирующий естественную репликацию ДНК и позволяющий обнаружить единственную специфическую молекулу ДНК в присутствии миллионов других молекул. Преимуществами данного метода являются высокая чувствительность и специфичность, доступность, быстрота (от 1 до 3 дней) и возможность автоматизации при проведении массовых исследований;

- Секвенирование – обеспечивает определение  генома и может применяться для диагностики всех типов организмов, прежде всего не поддающихся культивированию (например, вирусов и грибков, а также некоторых видов бактерий, оомицетов и грибков).  Может  использоваться для выявления конкретных регулируемых вредных организмов, а также неизвестных организмов (т.е. информация о наличии которых отсутствовала). Секвенирование генетического материала как метод применяется для идентификации генома микроорганизмов, представляющих фитосанитарный интерес, но которые не поддаются идентификации с использованием традиционных методов. Применение этого метода позволило установить присутствие ранее не обнаруживавшихся микроорганизмов, таких как грибки, бактерии, фитоплазма и прежде всего вирусы, в отношении которых применение данного метода более проработано, чем в отношении других патогенов.

Основные направления деятельности отдела молекулярных исследований:

- диагностические исследования по обнаружению генетического материала (ДНК/РНК) возбудителей инфекционных болезней животных и птиц, в том числе особо опасных болезней, общих для животных и человека  методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с детекцией методом электрофореза и в Real Time в биологическом и патологическом  материале от животных и птиц, а также в продуктах питания , культурах микроорганизмов, смывах с поверхностей;

- исследования на наличие генетически модифицированных организмов (ГМО) растительного происхождения в пищевых продуктах, кормах, кормовых добавках, семенах, зерне и посадочном материале методом полимеразной цепной реакции (ПЦР в формате Real Time);

- исследования по определению видовой принадлежности мясных и растительных ингредиентов, содержащихся в кормах, пищевых продуктах, продовольственном сырье растительного, животного происхождения, в том числе подвергшихся термической обработке методом полимеразной цепной реакции (ПЦР в формате Real Time). Исследования по определению видовой принадлежности тканей жвачных животных в целях недопущения заноса губкообразной энцефалопатии крупного рогатого скота (BSE) на территорию РФ;

- исследования в области карантина растений методом ПЦР-диагностики на наличие фитопатогенов в растительной продукции; образцов семенного и посадочного материала, продовольственных грузов, а так же материала, отобранного при проведении фитосанитарных обследований и мониторингов (саженцы, черенки и части растений, рассада цветов и других с/х культур, ), для выявления и идентификации карантинных и некарантинных возбудителей бактериальных, вирусных , фитоплазменных заболеваний методом ПЦР (классическая ОТ-ПЦР с детекцией методом электрофореза, ПЦР в формате Real Time)

- микологические исследования образцов семенного и посадочного материала, продовольственной и технической продукции, срезов цветов, горшечных растений для выявления и идентификации возбудителей грибных заболеваний методом ПЦР.

- исследования на подтверждение заражения подкарантинной продукции гельминтологическими, энтомологическими , микологическими объектами и вирусными и бактериальными патогенами методом секвенирования.

Все исследования проводятся в рамках реализации плана государственного задания, эпизоотологического мониторинга проводимого на территории Российской Федерации и оказании платных услуг.